Zafer Müzesi Afyonkarahisar Şehir merkezinde "Zafer Meydanı" nda yer almakta olup şehrimizin önemli sembollerinden biridir. Zafer Müzesi, 27 Ağustos 1922 tarihinde saat 17.30'da Afyonkarahisar'ın düşman işgalinden kurtuluşunu müteakip, Başkomutan Mustafa Kemal Paşa, Genel Kurmay Başkanı Fevzi Çakmak Paşa, Garp Cephesi Komutanı İsmet İnönü ve Garp Cephesi Harekât Şube Müdürü Tevfik Bıyıklıoğlu'nun bu tarihi binada kalmaları, burayı karargâh binası olarak kullanmaları ve Başkomutan Meydan Muharebesi Planını burada yapmalarından dolayı önem arz etmektedir.
Zafer Müzesi II. Grup Korunması gerekli Kültür Varlığı olarak tescil edilmiş olup 15.03.1991 tarihinde, Başkomutan Tarihi Milli Park Müdürlüğü'nce ''Zafer Müzesi'' olarak kullanılması, 12.05.1998 tarihinde ise Orman Bakanlığı adına tahsisi uygun görülmüştür.
Zafer Müzesi, Cumhuriyet öncesi (1915-1920) o zamanın belediye reisi Saitoğlu Mehmet Sait Efendi tarafından iki katlı olarak yaptırılmıştır. Bina genel hatları ile neo-klasik özellik taşımaktadır. Plân itibariyle de tipik Anadolu evleri tarzında (ortada hayat denilen büyük bir sofa, yanlarında bu sofaya açılan odalar) olduğu görülür.
2018 yılında restorasyona başlanan Zafer Müzesi 2021 tarihinde 2. Aşama olan ''Askıya Alınması ve Betonarme Eklentilerinin Kaldırılması İşi'' ihalesi yapılmıştır. Bu ihale ile binaya sonradan eklenen betonarme yapı kaldırılarak, galeri boşluğu açılmış ve orijinal haline dönmesi sağlanmıştır. Zafer Müzesinin güçlendirmesinin yapılabilmesi için, 3. Etabı olan Haziran 2023 tarihinde ''Statik Güçlendirme ve Restorasyon İşi'' ihalesi yapılmış, kireç esaslı enjeksiyon malzemesi duvarlara uygulanarak binanın güçlendirilmesi yapılmıştır. Son olarak; 4.Etap olan Kasım 2023 tarihinde ''Restorasyon ve Tefrişat Yapım İşi'' ihalesi yapılmış olup iç mekan düzenlemesi ile restorasyon tamamlanmıştır.
Restorasyonu tamamlanan Zafer Müzesi 26.08.2024 tarihinde saat:13.00' de törenle açılacaktır.