Sakarya, Susurluk, Konya, Marmara, Batı Karadeniz ve Meriç-Ergene Havzalarında;
a) Suyun havza ölçekli yönetimi ile alakalı ilke, strateji ve hedefleri tespit etmek,
b) Havza yönetim planlarını hazırlamak ve güncellemek, su kalitesinin iyileştirilmesi için plan ve projeler yapmak veya yaptırmak, uygulamalarını takip etmek ve raporlamak,
c) Havza yönetimi çalışmalarında kurumlar arası koordinasyonu sağlamak,
ç) Havza yönetim planlarında, temel ve tamamlayıcı tedbirleri dikkate alarak söz konusu olabilecek muafiyet ihtiyaçlarını gerekçelendirmek,
d) Havza yönetim planları kapsamında teklif edilen tedbirlerin sosyoekonomik analizini yapmak,
e) Göl, gölet, baraj gölleri ve sulak alanların su bütçeleri ve kalite kriterleri ile ilgili çalışmalar yapmak, kalite ve miktar durumlarını değerlendirmek ve iyileştirilmesi ile alakalı projeler hazırlamak veya hazırlatmak.
f) Yeraltı sularının korunmasına, kirliliğinin kontrolü ve önlenmesine yönelik ilke ve hedefleri belirlemek, politika ve stratejilerin belirlenmesi amacıyla çalışmalar yapmak,
g) Yeraltı suyu kütle belirleme, karakterizasyon, baskı, etki ve risk analizi çalışmaları ile kütlelerin doğal arka plan, kriter değer ve eşik değerlerinin tespit edilmesine ilişkin plan, proje ve çalışmalar yapmak veya yaptırmak,
ğ) Yeraltı suyunun kimyasal durumu konusundaki izleme verilerini değerlendirmek, kimyasal durumun bozulmasını, önemli ve artan kirlilik eğilimlerini ve iyileştirmeye geri dönüş noktalarını tespit etmek için plan, proje ve çalışmalar yapmak veya yaptırmak,
h) Jeotermal suların su kaynaklarına etkilerinin belirlenmesi ile ilgili çalışmalar yapmak,
ı) Yeraltı su kalitesinin iyileştirilmesi için plan ve projeler yapmak veya yaptırmak, uygulamalarını izlemek ve raporlamak,
i) Yeraltı suyu kütlelerinde yapılacak izleme çalışmalarına ilişkin plan ve programların hazırlanmasına katkıda bulunmak,
j) Yeraltı suyu kütlelerinin kalite ve miktar durumlarını değerlendirmek, korumak ve iyileştirmek için tedbir programları hazırlamak, projeler geliştirmek ve yürütmek,
k) Yeraltı suyu kütlelerinin kalitesinin korunması ve kirlenmesinin önlenmesi maksadıyla gerekli mevzuat çalışmalarını yapmak,
l) Hassas alanların yönetimi ile ilgili ilke ve hedefleri tespit etmek, politika ve stratejilerin belirlenmesi amacıyla çalışmalar yapmak,
m) Ötrofik olan ve ötrofik hale gelebilecek su kütlelerini, kentsel hassas alanları ve nitrata hassas alanları tespit etmek, su kalite hedeflerini belirlemek, bu alanların korunması ve iyileştirilmesi için alınması gerekli tedbirleri belirlemek ve uygulamaların takibini yapmak,
n) Hassas alanlarla ilgili kurum ve kuruluşlar arasında koordinasyonu sağlamak ve ortak çalışmalar gerçekleştirmek,
o) Hassas alanlarda yapılan ve yapılması planlanan su ürünleri yetiştiriciliği dâhil bütün faaliyetlerin su kalitesine etkisini değerlendirmek, görüş vermek,
ö) Hassas alanlarda ve baraj göllerinde kirletici özümleme kapasitelerinin belirlenmesine yönelik çalışmalar yapmak,
p) Yerüstü su kaynaklarının özümleme kapasitelerini belirlemek.
r) Göl, gölet ve baraj göllerinde kurulması planlanan balık yetiştiriciliği tesislerine su kalitesi açısından görüş vermek.
s) Çalışma Grubunun görev alanına giren hususlarda ulusal ve uluslararası çalışmaları takip etmek ve raporlamak, mevzuat hazırlamak, ihtiyaç duyulan konularda rehber doküman hazırlamak veya hazırlatmak, eğitim çalışmaları yapmak veya yaptırmak,
ş) Daire Başkanı tarafından verilen diğer görevleri yapmak.
