a) Kıyı ve geçiş suları dâhil yerüstü su kütleleri için biyolojik ve hidromorfolojik izlemeye ilişkin ilke ve hedefleri tespit etmek, politika ve stratejilerin belirlenmesi amacıyla çalışmalar yapmak, bu konudaki uygulamaları takip etmek ve raporlamak,

b) Ekosistem esaslı su kalitesi değerlendirme sistemiyle uyumlu olarak yerüstü su kütlelerinde biyolojik ve hidromorfolojik izleme, araştırma ve değerlendirme çalışmaları yapmak veya yaptırmak,

c) Biyolojik kalite unsurları açısından su kütlesi tiplerine özgü referans şartların belirlenmesi çalışmalarını yapmak veya yaptırmak,

ç) Su kütlelerinde izlenecek biyolojik, mikrobiyolojik ve hidromorfolojik parametreleri, örnekleme noktalarını, izleme sıklıklarını ve izleme yöntemlerini belirlemek,

d) Su kütlelerinde biyolojik , hidromorfolojik ve mikrobiyolojik kalite parametrelerini izlemek veya izletmek, izleme neticelerini değerlendirmek ve ilgili birimlere raporlamak,

e) Biyolojik ve hidromorfolojik kalite bileşenleri için izleme sonuçlarının değerlendirilmesi ile ilgili indeksleri belirlemek,

f) Su kaynakları kapsamında biyolojik izleme sonuçları ve durum değerlendirmesi ile ilgili Avrupa Birliği kapsamında yürütülen çalışmaları takip etmek, yürütmek ve koordinasyonu sağlamak,

g) Su kütlelerindeki hidromorfolojik baskı unsurlarını belirlemek ve hidromorfolojik baskı değerlendirme çalışmalarını yürütmek,

ğ) Büyük ölçüde değiştirilmiş su kütleleri ile yapay su kütlelerinin belirlenmesine ilişkin kriterlerin ortaya konulması çalışmalarını yürütmek,

h) Biyolojik ve hidromorfolojik verilerle istatistiki değerlendirmeler yapmak,

ı) Su kaynakları ve kütleleri ile ilgili hidrolojik ve hidromorfolojik çalışma, araştırma, geliştirme, indeks ve uygulama çalışmaları yapmak veya yaptırmak,

i) Yerüstü su kalite sınıfına karar vermek, su kalitesinin iyileştirilmesi için plan ve projeler yapmak veya yaptırmak, uygulamalarını izlemek ve raporlamak,

j) Kıyı ve geçiş suları dâhil yerüstü sularının kalitesini, alıcı ortam kirletici özümleme kapasitesini, su kalitesini belirlemek için gerekli olan kirleticiler ile çevresel kalite standartlarını ve çevresel kalite hedeflerini tespit etmek, uygulamalarını izlemek, bu konularla alakalı araştırma ve geliştirme çalışmalarını yapmak veya yaptırmak,

k) Faaliyetlerin kıyı ve geçiş suları dahil yerüstü sularında söz konusu olabilecek hidromorfolojik ve ekolojik etkilerini belirlemek,

l) Yerüstü suyu kütlelerinde yapılacak izleme çalışmalarına ilişkin plan ve programların hazırlanmasına destek olmak ve katkıda bulunmak,

m) Çalışma Grubunun görev alanına giren hususlarda ulusal ve uluslararası çalışmaları takip etmek ve raporlamak, mevzuat hazırlamak, ihtiyaç duyulan konularda rehber doküman hazırlamak veya hazırlatmak, eğitim çalışmaları yapmak veya yaptırmak,

n) Daire Başkanı tarafından verilen diğer görevleri yapmak.

​