- Suyun havza ölçekli yönetimi ve su kaynaklarının etkin ve verimli bir şekilde korunması, geliştirilmesi ve kullanılmasına dair ilke, strateji ve hedefleri belirlemek, mevzuatını hazırlamak,
- Havza yönetim planları ile ilgili ilke, esas, strateji ve politikaları belirlemek, Havza Koruma Eylem Planlarını ve Havza Yönetim Planlarını hazırlamak veya hazırlatmak ve uygulamaların takibini yapmak,
- Alıcı ortam kirliliğinin önlenmesi ve su kalitesinin iyileştirilmesi ile alakalı planlar hazırlamak, tedbirleri ilgili kurumlar ile birlikte belirlemek ve uygulamaların takibini yapmak,
- Yeraltı suyu kütlelerini belirleyerek bu kütlelerin kalite ve miktar durumlarını değerlendirmek, eşik değerleri, kalite sınıfını belirlemek, yeraltı suyu kütlelerini korumak ve iyileştirmek için plan ve projeler yapmak veya yaptırmak,
- Su kaynaklarının havza ölçekli sektörel bazda tahsisine ilişkin planları hazırlamak veya hazırlatmak, uygulamaları takip etmek ve gerekli koordinasyonu yapmak, sektörel su tahsisi envanterini tutmak ve bununla ilgili iş ve işlemleri yürütmek,
- Hassas su alanları ve nitrata hassas alanları belirlemek, bu alanlarda politikaları oluşturmak, su kalitesini iyileştirmeye yönelik tedbirleri hazırlamak veya hazırlatmak ve uygulamaları takip etmek,
- Göl, gölet, baraj gölleri ve sulak alanların su bütçeleri ve kalite kriterleri ile ilgili çalışmalar yapmak, özümleme kapasitelerini belirlemek, kalite ve miktar durumlarını değerlendirmek ve iyileştirilmesi ile alakalı projeler hazırlamak veya hazırlatmak, uygulamaları takip etmek,
- Göl, gölet ve baraj göllerinde kurulması planlanan balık yetiştiriciliği tesisleri başta olmak üzere su kaynaklarının kalitesini etkileyebilecek faaliyetler için görüş vermek,
- Suyun havza esaslı yönetimi kapsamında sosyoekonomik analiz ve değerlendirmelere ilişkin politika, strateji belirlemek ve gerekli çalışmaları yapmak,
- Daire başkanlığı görev alanına giren hususlarda koordinasyon dâhilinde ulusal ve uluslararası çalışmaları takip etmek ve raporlamak, mevzuat hazırlamak, ihtiyaç duyulan konularda rehber doküman hazırlamak ve eğitim yapmak veya yaptırmak.